Справившись с Боузером и защитив Бруклин, Марио снова оказывается перед серьёзной угрозой. На этот раз коварный Варио объединил усилия с Боузером-младшим, создав опасный союз. Их амбиции простираются далеко — ни больше, ни меньше, чем покорение всего мира. Марио не может остаться в стороне. К счастью, он не один: верные друзья готовы поддержать его, а ещё рядом окажется неунывающий Йоши. Вместе им предстоит пройти через новые испытания, чтобы сорвать коварные замыслы врагов и не дать им установить свой контроль.